Discovery Studio電腦版

Discovery Studio 2021是一款功能非常強(qiáng)大的分子建模軟件，該軟件擁有的功能十分強(qiáng)大，支持模型構(gòu)型、模型分析、科學(xué)應(yīng)用、腳本編寫、圖像分析、藥理基團(tuán)、蛋白質(zhì)建模、RL互動、序列分析、排序、模擬以及X射線等多種的功能，但是其主要的功能就是讓用戶能夠在編輯化學(xué)教材的時候擁有超多的模型和圖紙設(shè)計方案。它可以夠幫助用戶輕松進(jìn)行各種分子建模的工作，甚至還有效的提升了用戶的角膜效率，從而讓分子的研究更加的高效。使用它，用戶可以通過高質(zhì)量的圖形、多年專業(yè)驗證的技術(shù)以及集成的環(huán)境，從而為用戶提供實驗數(shù)據(jù)保存、管理與專業(yè)水準(zhǔn)的建模，這樣就可以提高我們用戶在建模上的效率。除此之外，Discovery Studio軟件在化學(xué)方面，是可以通過數(shù)據(jù)建立分子模型，甚至還可以分析多種實驗以及物體的結(jié)構(gòu)，完全是支持生成模型輸出到打印機(jī)上；然后在生物分析方面，也是支持將不同的基因序列放到軟件上進(jìn)行計算的，并且還可以以對比不同序列的變化，從而從而知道蛋白質(zhì)、DNA的實驗結(jié)果。

Discovery Studio 2021安裝步驟：

1、在本站下載解壓文件，解壓得到Discovery Studio 2021原程序和補(bǔ)丁文件夾；

2、選擇“DS45Client.exe”開始安裝軟件，單擊“下一步”；

3、選擇自己的安裝路徑，

4、點(diǎn)擊安裝

5、安裝中，請稍候

6、將補(bǔ)丁文件復(fù)制到安裝路徑

7、以上就是Discovery Studio的全部安裝教程，大家可以免費(fèi)使用。

Discovery Studio 2021使用方法

1、雙擊打開軟件，如下圖

2、進(jìn)入軟件，顯示很多示例文件，這里可以點(diǎn)擊第一個Protein Structure蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)查看

3、如圖所示，這里就是蛋白質(zhì)的編輯樣式，如果你需要自己設(shè)計，可以從化學(xué)界面上找到模型

4、點(diǎn)擊Multiple sequence alignment功能，可以將您的多序列比對

5、提示一些關(guān)于DNA的子項目，可以點(diǎn)擊DNA-Single Strand查看鏈接，也可以查看不同的分子樣式

6、點(diǎn)擊Chemistry可以查看軟件的化學(xué)結(jié)構(gòu)，可以分析立體化學(xué)模型

軟件功能

1、圖形選項卡-圖形視圖顯示樣式對話框

“圖形視圖顯示樣式”對話框上的“圖形”選項卡允許您為當(dāng)前“分子窗口”設(shè)置常規(guī)圖形屬性。該選項卡始終可用，并且在保存文件時，此處指定的設(shè)置將與其余數(shù)據(jù)一起保存。該窗口中的設(shè)置是通過“分子窗口” |“分子窗口”訪問的全局應(yīng)用程序設(shè)置的子集。圖形首選項頁面。

2、投影

這些選項使您可以設(shè)置兩種不同投影模式的分子顯示：

正交投影：正交投影可產(chǎn)生一個視圖，在該視圖中，對象與觀察者之間的距離無視其大小相同。正射投影通常用于工程圖形中，并具有更高的精度。

透視圖：透視圖投影會產(chǎn)生一個視圖，其中距離觀察者較遠(yuǎn)的對象看起來比靠近觀察者的對象小。這類似于人眼觀察世界和照相機(jī)產(chǎn)生照片的方式。透視投影通常通過強(qiáng)調(diào)模型的深度而非大小來提供更真實的模型表示。

角度：透視角度控制透視投影中出現(xiàn)的縮短距離。較小的角度可減小透視度，而較大的角度可增大透視度。角度限制為1到120度之間的值。默認(rèn)值為45.00°。

3、質(zhì)量

質(zhì)量設(shè)置控制用于顯示蛋白質(zhì)和DNA / RNA的3維對象的粗糙度。較低的質(zhì)量設(shè)置將通過增加粗糙度來改善渲染性能。較高的質(zhì)量設(shè)置可以改善視覺外觀。

對于常規(guī)使用，請選擇能夠最佳組合性能和質(zhì)量的設(shè)置。如果要導(dǎo)出圖像，請選擇“超高”以獲得最佳質(zhì)量。

4、背景顏色

這將打開“選擇顏色”對話框，您可以在其中選擇當(dāng)前窗口的背景色。

5、其他選擇

線寬：控制用于以線顯示樣式和單元格邊界渲染對象（例如分子）的線的粗細(xì)。

深度提示：打開時，距離觀察者較遠(yuǎn)的對象會逐漸融合到背景中，而靠近觀察者的對象將以完整，明亮的顏色顯示。通過更明亮地照亮附近的物體，而更遠(yuǎn)的物體逐漸消失在黑暗中，此功能可以更好地感覺景深。關(guān)閉深度提示后，無論物體顏色與觀察者的距離有多遠(yuǎn)，物體的顏色都將充滿而明亮。

6、原子選項卡-“圖形視圖顯示樣式”對話框

“ 圖形視圖顯示樣式”對話框上的“ 原子”選項卡控制原子和鍵的圖形表示。

7、展示風(fēng)格

無：將選定的原子空白，使其不顯示在屏幕上。您可以使用這種樣式來簡化復(fù)雜的分子，方法是僅顯示感興趣的原子，或者在將蛋白質(zhì)顯示為條帶時隱藏原子。

線：使用傳統(tǒng)的線框顯示器顯示原子。未結(jié)合的原子顯示為插孔。

搖桿：使用實心圓柱體顯示粘結(jié)。非化學(xué)鍵原子顯示為千斤頂作為一個 線風(fēng)格。的棒尺寸參數(shù)改變棒的厚度。

球和棒：使用圓柱體來描述鍵，原子來描述球。使用“ 球尺寸”和“ 桿尺寸”參數(shù)確定 球和桿的尺寸。

縮放的球和棒：使用圓柱體和原子進(jìn)行鍵合，并使用縮放到范德華（VDW）半徑的球。使用“ 球尺寸”和“ 桿尺寸”參數(shù)確定球和桿的尺寸。您可以通過選擇化學(xué)|自定義每個元素的默認(rèn)VDW半徑。菜單欄中的元素屬性...命令。

CPK：顯示大小與范德華（VDW）半徑相同的球。該CPK規(guī)模設(shè)定乘以VDW半徑由給定因素。您可以使用化學(xué)|自定義每個元素的默認(rèn)VDW半徑。元素屬性...命令。

多面體：顯示原子周圍的配位多面體。這種樣式主要用于材料和無機(jī)分子。該多面體風(fēng)格創(chuàng)建具有四個或更多債券的原子多面體。對聚合物的最終效果類似于鏈中的珠子。少于四個鍵的原子顯示為線，不顯示沒有鍵的原子。

8、染色

著色方式：您可以通過多種方式為原子著色?！?顏色依據(jù)”列表具有多種預(yù)定義的配色方案，包括：

元素：使用為其元素定義的顏色為每個原子著色。您可以通過選擇化學(xué)|更改基本元素的顏色。菜單欄中的元素屬性...命令。

父色：通過包含原子的父對象的顏色為每個原子著色。例如，如果氨基酸中包含原子，則該原子被氨基酸的顏色著色。

分子顏色：通過原子所屬的分子的顏色為每個原子著色。

局部電荷：通過其局部電荷為每個原子著色。顏色是從紅色（帶負(fù)電荷）到藍(lán)色（帶正電荷）的漸變中獲取的。

<其他>：根據(jù)在分子上計算出的原子和分子屬性以及模型的層次結(jié)構(gòu)，許多其他配色方案會自動添加到可用選項中。這些配色方案由包含原子的層次結(jié)構(gòu)中的分子對象命名，顏色基于模型中這些對象的數(shù)量。例如， 如果加載的蛋白質(zhì)包含多條鏈，則將Molecule，AminoAcidChain和AminoAcid方案添加到顏色選項中。如果您使用分子方案，則分子中的所有原子都是單一顏色（通常在文檔中只有一個分子）。如果您通過AminoAcidChain著色，一條鏈中的所有原子都著色為一種顏色，而第二條鏈中的所有原子均著色為另一種顏色。

注意。數(shù)據(jù)表中包含數(shù)字的任何列都可以用作顏色標(biāo)準(zhǔn)。

顏色...：此按鈕將啟動“ 顏色映射”對話框。

自定義：選擇單選按鈕，然后單擊顏色框以顯示“ 選擇顏色”對話框。定義顏色后，單擊“ 應(yīng)用”按鈕或“ 確定”按鈕，將自定義顏色應(yīng)用于選定的原子。

僅碳原子：選中此框可將自定義顏色僅應(yīng)用于碳原子。

9、更多控制

顯示債券定單：此復(fù)選框控制多個債券的顯示方式是否與單個債券不同。該選項影響Line，Stick和Ball and Stick的顯示樣式。

球尺寸，棒尺寸，CPK比例：使用這些字段可自定義比例適當(dāng)?shù)墓δ堋?

10、蛋白質(zhì)選項卡-圖形視圖顯示樣式對話框

該蛋白質(zhì)的圖形視圖顯示樣式對話框中的選項卡允許您控制的氨基酸和氨基酸鏈的表示圖形視圖。

有幾種可用的表示方式，突出顯示了蛋白質(zhì)分子的關(guān)鍵特征，以允許檢查更高級別的結(jié)構(gòu)信息。

11、其他控制

等值線：更改實體，三角形網(wǎng)格和四邊形網(wǎng)格等值面顯示的幾何形狀。

線寬：當(dāng)?shù)戎得骘@示為“ 三角形網(wǎng)格”或“ 四邊形網(wǎng)格”顯示時，控制線的粗細(xì) 。

直方圖：顯示文件中包含的等值面數(shù)據(jù)的范圍。移動直方圖左側(cè)和右側(cè)的兩個青色滑塊，以控制光譜的分布。左側(cè)滑塊下方的值被分配為最左側(cè)的顏色。右滑塊上方的值被分配為最右邊的顏色。如果選中了“ 超出范圍限制”選項，則這些值將不會顯示在“分子窗口”中。

顯示框：選中此選項將導(dǎo)致顯示等值面的邊界框。

光譜：包含可應(yīng)用于“ 體積 等值面”顯示的各種光譜。所選光譜顯示在直方圖的底部。

帶：頻譜控制是否顯示在2， 4，8，16，32，64，或128顏色的條帶。默認(rèn)值為32。

透明度：控制體積等值面數(shù)據(jù)的透明度。向左滑動控件，使等值面顯示更加透明。向右滑動控件，使等值面顯示更加不透明。

剪輯超出范圍：當(dāng)直方圖中的值受到限制時，控制等值面信息的顯示。取消選中此框時，超出范圍的值分別分配為最左側(cè)和最右側(cè)。選中此框時，根本不會顯示超出范圍的值。