Primer Premier(引物設計軟件) v6.24

Primer Premier 6是加拿大Premier公司推出的一款專業(yè)的引物設軟件，軟件主體分為四大部分，尤其常用的是引物設計、限制性內切酶位點分析和DNA基元（motif）查找，給專業(yè)人員帶來的極大的便利。

小編為大家?guī)淼腜rimer Premier 6.24最新版本功能更加強大，立足點也是按照引物設計的基本原則，只是更加快速和自動化而已。我們可以直接提交模板序列到特定網頁，如著名的primer3，得到設計好的引物，也可以在本地計算機上運行引物設計專業(yè)軟件，支持win7 操作系統(tǒng)，具有PCR或測序引物以及雜交探針設計功能，有需要的朋友請下載體驗。

軟件功能

1、CR引物設計：設計引物對用于PCR和多重實驗。

2、跨物種：擴增來自多個物種的序列。

3、致病性檢測：在高度保守的區(qū)域中定位寡核苷酸。

4、等位基因特異性：僅擴增一組相關序列中的單個成員。

5、簡并：從氨基酸序列開始，反向翻譯并自動設計低簡并區(qū)域的寡核苷酸。

6、嵌套/多重：檢查多個候選寡核苷酸之間的同源性。

7、限制酶和基序分析：從數(shù)據(jù)庫中選擇800多種酶和200種常見基序。

8、Clustal W比對：使用任何資源（包括EBI）在執(zhí)行ClustalW比對后加載比對序列。

9、多序列比對：使用流行的Clustal W算法來對齊桌面上的序列（僅適用于Windows版本）。

10、算法：使用Breslauer值計算Tm。

長PCR-處理最多50 KB的序列。

軟件特色

1、主要界面可分為序列編輯窗口（Genetank），引物設計窗口（Primer Design），酶切分析窗口（Restriction Sites）和紋基分析窗口（Motif）四大塊

2、該軟件就是用來進行引物設計的，進行這些操作非常簡單

3、可以簡單地通過手動拖動鼠標以擴增出相應片段所需的引物

4、在手動的任何時候，下面顯示各種參數(shù)的改變和可能的二聚體、異 二聚體、發(fā)夾結構等。也可以給定條件，讓軟件自動搜索引物，并將引物分析結果顯示出來

primer6設計引物教程

1、首先，選取目的基因序列，對格式沒有什么要求，只需要將目的基因序列復制就可以。

2、打開File目錄下的New，選擇Sequence。這里的另一個project選項是導入文件的方式，也就是將目的基因以文件形式保存的可以直接導入文件。一般通過復制的方式會更方便。

3、打開Sequence后，會彈出粘貼框，只需要將剛剛復制的基因序列粘貼上即可，然后點擊下方的Add。

4、選擇上方的紅藍雙向箭頭的按鈕進行引物設計，在設計開始前可以更改設計的參數(shù)，包括搜索的堿基范圍、引物的長度，堿基數(shù)，設計結果顯示的引物對數(shù)等。

5、設置完參數(shù)后，點擊下方的Search，軟件開始分析設計，完成后，點擊OK。設計結果就會在下面顯示出來。

6、結果中藍色為前引物，紅色為后引物，Rating是對引物的綜合評價分數(shù)，在上方也會顯示引物的優(yōu)劣，最好的為Best，中等為Good，最次的為Poor。一般選擇引物都為Best或Good，其它顯示均是無法使用的。

7、在右邊還有兩個選項，All Primers可以查看可選擇的多對不同引物?？梢愿鶕?jù)需要選擇合適位置和適當產物長度的引物。選擇后需要點擊下方的Replace才能替換。

8、All Structers則可以查看當前選定引物的結構，如發(fā)夾結構，引物二聚體和重復堿基等。

9、引物選定完成后，點擊下方的引物序列，再右鍵會彈出復制信息選項，進而將設計好的引物導出。也可以直接以文件的形式將結果導出。