FastPCR是一款簡(jiǎn)單易用,功能強(qiáng)大的PCR引物設(shè)計(jì)軟件。它為用戶提供了一個(gè)集成的工具環(huán)境,為設(shè)計(jì)任何類型的PCR引物提供全面而專業(yè)的設(shè)計(jì)輔助工具,可用于分析硅片,pcr集成工具環(huán)境,PCR引物或探針設(shè)計(jì)等場(chǎng)合,包括各種生物信息學(xué)工具,還具備處理長(zhǎng)序列和核酸或蛋白質(zhì)序列組的能力,功能非常豐富,有需求的用戶請(qǐng)下載安裝!
軟件功能
1、FastPCR軟件是一個(gè)集成的工具環(huán)境,為設(shè)計(jì)任何類型的PCR引物提供全面而專業(yè)的設(shè)施,用于標(biāo)準(zhǔn),長(zhǎng)距離,反向,實(shí)時(shí)PCR(LUX和自我報(bào)告),多重PCR,Xtreme Chain Reaction(XCR),組特異性(用于遺傳相關(guān)DNA序列的通用引物)或獨(dú)特的(來自遺傳相關(guān)DNA序列的特異性引物),重疊延伸PCR(OE-PCR)多片段組裝克隆和LAMP(環(huán)介導(dǎo)的等溫?cái)U(kuò)增); 單引物PCR(從密切定位的反向重復(fù)序列設(shè)計(jì)PCR引物),自動(dòng)檢測(cè)SSR基因座和直接PCR引物設(shè)計(jì),氨基酸序列簡(jiǎn)并PCR,聚合酶鏈裝配(PCA),平鋪感興趣區(qū)域的設(shè)計(jì)擴(kuò)增子以及更多。
2、“ 計(jì)算機(jī)模擬”(虛擬)PCR引物或針對(duì)全基因組的探針?biāo)阉骰蛴?jì)算機(jī)模擬PCR或可能的PCR產(chǎn)物的染色體預(yù)測(cè)列表以及搜索指定引物或探針的潛在錯(cuò)配位置。在一定范圍內(nèi)同時(shí)搜索多個(gè)目標(biāo)。“ in silico ”寡核苷酸搜索有助于通過溫度熔解和PCR退火溫度計(jì)算發(fā)現(xiàn)靶結(jié)合位點(diǎn)。
3、可以設(shè)計(jì)長(zhǎng)寡核苷酸用于微陣列分析,并且可以設(shè)計(jì)用于探針的雙標(biāo)記寡核苷酸,例如分子信標(biāo)。
軟件亮點(diǎn)
1、綜合引物測(cè)試,標(biāo)準(zhǔn)和簡(jiǎn)并寡核苷酸的熔解溫度計(jì)算,引物的PCR效率和語言復(fù)雜性,稀釋和重懸浮計(jì)算器。
2、分析所有引物二級(jí)結(jié)構(gòu)的引物(探針),包括與Watson-Crick堿基配對(duì)的替代氫鍵,例如G / C-四鏈體或擺動(dòng)堿基對(duì)(如GG,GT,GA),發(fā)夾,自身二聚體和交叉 - 引物對(duì)中的二聚體。該軟件利用所有工具的正常和簡(jiǎn)并引物的組合,并且用于熔解溫度計(jì)算基于最近鄰熱力學(xué)參數(shù)。
3、FastPCR具有處理長(zhǎng)序列和核酸或蛋白質(zhì)序列組的能力,它允許每個(gè)給定序列的單個(gè)任務(wù)和參數(shù),并連接單個(gè)運(yùn)行的幾個(gè)不同任務(wù)。它還允許序列編輯和數(shù)據(jù)庫(kù)分析。
4、通過可視化開發(fā)并應(yīng)用于程序的各種類型重復(fù)的高效和完整檢測(cè)。
5、該程序包括各種生物信息學(xué)工具,用于分析具有GC或AT偏斜的序列,CG%和GA%含量和嘌呤 - 嘧啶偏斜,語言序列復(fù)雜性; 生成隨機(jī)DNA序列,限制性I-II-III類型酶和歸巢核酸內(nèi)切酶分析,找到或創(chuàng)建編碼序列的限制酶識(shí)別位點(diǎn),并支持序列聚類和共有序列生成以及序列相似性和保守性分析。
系統(tǒng)要求
系統(tǒng)需求:Microsoft Windows 10/8/7 / Vista / 2003 / XP(32位(x86)或64位(x64)
內(nèi)存:2 GB RAM
顯示:最低屏幕分辨率為1280x800
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